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紫外線主要是通過對微生物(細菌、病毒、芽孢等病原體)的輻射損傷和破壞核酸的功能使微生物致死，從而達到消毒的目的。紫外線對核酸的作用可導致鍵和鏈的斷裂、股間交聯和形成光化產物等，從而改變了DNA的生物活性，使微生物自身不能復制，這種紫外線損傷也是致死性損傷。紫外線消毒是一種物理方法，它不向水中增加任何物質，沒有副作用，這是它優于氯化消毒的地方，它通常與其它物質聯合使用，常見的聯合工藝有UV+H2O2、UV+H2O2+O3、UV+TiO2。 
現代紫外線消毒技術是基于現代防疫學、光學、生物學和物理化學的基礎上，利用特殊設計的高效率，高強度和長壽命的C波段紫外光發生裝置，產生的強紫外C光照射空氣或物體表面，當空氣或固體表面中的各種細菌、病毒、寄生蟲、水藻以及其它病原體受到一定劑量的紫外C光輻射后，其細胞中的DNA結構受到破壞，從而在不使用任何化學藥物的情況下殺滅細菌、病毒，以及其它致病體，達到消毒和凈化的目的。它具有高效、廣譜、價廉、長壽、操作簡便、運行費用低、不產生任何二次污染的優點。 大多數紫外線裝置利用傳統的低壓紫外燈技術，也有一些大型水廠采用低壓高強度紫外燈系統和中壓高強度紫外燈系統，由于產生高強度的紫外線可能使燈管數量減少90%以上，從而縮小了占地面積，節約了安裝和維修費用。 對室內空氣的消毒: 間接照射法：首選高強度紫外線空氣消毒器，不僅消毒效果可以， 而且可在室內有人活動時使用，一般開機消毒 30min 即可達到消毒合格。 直接照射法：在室內無人條件下，可采取紫外線燈懸吊式或移動式直接照射。采用室內懸吊式紫外線消毒時，室內安裝紫外線消毒燈（30W紫外線燈，在1.0米處的強度＞70 uW／cm2）的數量為平均每立方米不少于1．5W 照射時間不少于 30min。
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