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安捷倫科技推出用于新一代測序靶向序列捕獲系統(tǒng)的最新定制試劑盒

發(fā)布時間:2011-6-30 11:51    發(fā)布者:Liming
安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日宣布推出用于新一代測序(NGS) SureSelect XT 靶向序列捕獲系統(tǒng)的最新定制試劑盒,該試劑盒可捕獲高達 34 Mb 的目標(biāo)基因組區(qū)域。

新版定制試劑盒的序列覆蓋范圍比舊版擴展了 5 倍,這使得研究人員能夠?qū)⒀芯糠秶鷱娜祟愅怙@子擴展到對動物、微生物、植物及其它生物體中較大的目標(biāo)區(qū)域進行測序,目前尚沒有針對此類研究的商業(yè)化預(yù)定義或目錄版的靶向序列捕獲試劑盒。

現(xiàn)在研究人員可以利用目錄試劑盒或定制試劑盒對高達 34 Mb 的序列進行研究,這種撒大網(wǎng)的方式有利于發(fā)現(xiàn) SNP、插入/缺失以及拷貝數(shù)變異。然后他們可以設(shè)計有針對性的自定義序列捕獲文庫,用于后續(xù)的大量樣品研究。安捷倫提供 eArray 在線靶向序列捕獲和芯片設(shè)計工具,可幫助用戶設(shè)計并訂購 SureSelect XT 定制版靶向序列捕獲試劑盒(可選 10 到 5000 次反應(yīng),及適用于各種主流 NGS 平臺的格式)。

安捷倫 SureSelect 平臺市場總監(jiān) Fred P. Ernani 博士說:“安捷倫在定制長鏈寡核苷酸制造方面的出眾能力再加上 eArray 設(shè)計工具的強大功能,能夠為研究人員帶來卓越的具有高度靈活性且可定制的 NGS 靶向序列捕獲系統(tǒng)。現(xiàn)在,安捷倫能夠為研究人員提供 200 Kb 到 34 Mb 的大范圍定制捕獲試劑盒,幾乎適用于任何規(guī)模的研究。”

隨著測序結(jié)果的不斷產(chǎn)生,研究人員可以不斷采用 SureSelect 和 eArray 工具反復(fù)進行快速設(shè)計和完善。現(xiàn)在,SureSelect XT 用戶擁有全面的文庫設(shè)計選擇,從可直接使用的目錄版試劑盒到結(jié)合了目錄版和定制版內(nèi)容的復(fù)合設(shè)計試劑盒,再到完全定制設(shè)計的試劑盒。

擁有DNA 靶向序列捕獲和 RNA 靶向序列捕獲的 SureSelect XT 產(chǎn)品線成為應(yīng)用范圍最廣的新一代靶向測序技術(shù)平臺。定制試劑盒的不斷發(fā)展使得早期使用的客戶能夠捕獲超過 60 Mb 的序列。

靶向序列捕獲工作流程

靶向序列捕獲使研究人員可以僅對目標(biāo)基因組區(qū)域(而非整個基因組)進行測序,從而簡化NGS工作流程。結(jié)合領(lǐng)先的新一代測序系統(tǒng)的更高速度,SureSelect XT 的多重檢測支持功能使得研究人員在每次實驗中都能更全面地認(rèn)識更多樣品的基因組,這在過去是難以實現(xiàn)的。文庫制備和靶向序列捕獲流程的瓶頸已經(jīng)得到有效解決。

為進一步提高處理通量,安捷倫還提供了集成式工作站,用于自動化完成 SureSelect XT 文庫制備和靶向序列捕獲工作流程。可針對多重測序?qū)悠愤M行索引,且所有試劑都適合自動化操作。不久之后,安捷倫的 Bravo 自動化液體處理系統(tǒng)所支持的自動化方案將增加 RNA 捕獲自動化統(tǒng)包方案。

SureSelect 靶向序列捕獲平臺作為基因發(fā)現(xiàn)的核心工具,現(xiàn)已被 50 多篇同行評審的論文所引用。《科學(xué)》雜志 12 月 17 日刊登的 2010 年十大科學(xué)突破中,其中兩項突破“Reading the Neandertal Genome”(解讀尼安德特人基因組)和“Homing In on Errant Genes”(外顯子組測序/罕見疾病基因)均采用了本系統(tǒng)。
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