安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日宣布推出用于新一代測序(NGS) SureSelect XT 靶向序列捕獲系統的最新定制試劑盒,該試劑盒可捕獲高達 34 Mb 的目標基因組區域。 新版定制試劑盒的序列覆蓋范圍比舊版擴展了 5 倍,這使得研究人員能夠將研究范圍從人類外顯子擴展到對動物、微生物、植物及其它生物體中較大的目標區域進行測序,目前尚沒有針對此類研究的商業化預定義或目錄版的靶向序列捕獲試劑盒。 現在研究人員可以利用目錄試劑盒或定制試劑盒對高達 34 Mb 的序列進行研究,這種撒大網的方式有利于發現 SNP、插入/缺失以及拷貝數變異。然后他們可以設計有針對性的自定義序列捕獲文庫,用于后續的大量樣品研究。安捷倫提供 eArray 在線靶向序列捕獲和芯片設計工具,可幫助用戶設計并訂購 SureSelect XT 定制版靶向序列捕獲試劑盒(可選 10 到 5000 次反應,及適用于各種主流 NGS 平臺的格式)。 安捷倫 SureSelect 平臺市場總監 Fred P. Ernani 博士說:“安捷倫在定制長鏈寡核苷酸制造方面的出眾能力再加上 eArray 設計工具的強大功能,能夠為研究人員帶來卓越的具有高度靈活性且可定制的 NGS 靶向序列捕獲系統,F在,安捷倫能夠為研究人員提供 200 Kb 到 34 Mb 的大范圍定制捕獲試劑盒,幾乎適用于任何規模的研究。” 隨著測序結果的不斷產生,研究人員可以不斷采用 SureSelect 和 eArray 工具反復進行快速設計和完善,F在,SureSelect XT 用戶擁有全面的文庫設計選擇,從可直接使用的目錄版試劑盒到結合了目錄版和定制版內容的復合設計試劑盒,再到完全定制設計的試劑盒。 擁有DNA 靶向序列捕獲和 RNA 靶向序列捕獲的 SureSelect XT 產品線成為應用范圍最廣的新一代靶向測序技術平臺。定制試劑盒的不斷發展使得早期使用的客戶能夠捕獲超過 60 Mb 的序列。 靶向序列捕獲工作流程 靶向序列捕獲使研究人員可以僅對目標基因組區域(而非整個基因組)進行測序,從而簡化NGS工作流程。結合領先的新一代測序系統的更高速度,SureSelect XT 的多重檢測支持功能使得研究人員在每次實驗中都能更全面地認識更多樣品的基因組,這在過去是難以實現的。文庫制備和靶向序列捕獲流程的瓶頸已經得到有效解決。 為進一步提高處理通量,安捷倫還提供了集成式工作站,用于自動化完成 SureSelect XT 文庫制備和靶向序列捕獲工作流程。可針對多重測序對樣品進行索引,且所有試劑都適合自動化操作。不久之后,安捷倫的 Bravo 自動化液體處理系統所支持的自動化方案將增加 RNA 捕獲自動化統包方案。 SureSelect 靶向序列捕獲平臺作為基因發現的核心工具,現已被 50 多篇同行評審的論文所引用。《科學》雜志 12 月 17 日刊登的 2010 年十大科學突破中,其中兩項突破“Reading the Neandertal Genome”(解讀尼安德特人基因組)和“Homing In on Errant Genes”(外顯子組測序/罕見疾病基因)均采用了本系統。 |