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科學(xué)家開發(fā)出生物計算機 能破譯DNA芯片圖像

發(fā)布時間:2012-2-9 19:27    發(fā)布者:1770309616
關(guān)鍵詞: DNA , 科學(xué)家 , 生物計算機
據(jù)美國物理學(xué)家組織網(wǎng)2月8日(北京時間)報道,美國加州斯克里普斯研究院和以色列理工學(xué)院科學(xué)家開發(fā)出一種生物計算機,目前可用于破譯存儲在DNA芯片中的加密圖像。這是首次通過實驗演示基于DNA計算的分子圖像密碼系統(tǒng)。相關(guān)論文發(fā)表在最新一期《應(yīng)用化學(xué)》上。

電子計算機由硬件、軟件、輸入和輸出4個部分構(gòu)成,輸入、輸出的是電子信號,硬件是各種金屬、塑料、導(dǎo)線、晶體管的復(fù)雜組合,軟件是一系列電子信號形式的機器指令。而生物計算機這4個部分全是分子,所有生物系統(tǒng)甚至整個有機生物界、每個人都是一臺生物分子計算機,其硬件和軟件是復(fù)雜的生物分子,分子之間能有邏輯地進行“交談”。它們互相激活,執(zhí)行某個預(yù)定的化學(xué)反應(yīng)。輸入是一種經(jīng)過特殊預(yù)定變化的分子,遵循一套特殊的法則(軟件),這種化學(xué)計算過程的輸出,是另一種明確規(guī)定好了的分子。

  新開發(fā)的生物計算機是把化學(xué)成分和一種裝有溶液的管子連接在一起,溶液中混合著各種不同的小DNA分子、經(jīng)過選擇的DNA酶和ATP(三磷酸腺苷)。“這是一種清澈的溶液,你看不到任何東西。”領(lǐng)導(dǎo)該研究的以色列理工學(xué)院教授艾胡德·柯南說,“當(dāng)分子開始相互作用,我們就可以靜候結(jié)果。還可以調(diào)整混合液中DNA和DNA酶改變處理過程,以得到想要的結(jié)果。”

  生物計算機是根據(jù)圖靈機的模型設(shè)計的,圖靈機的操作與DNA鏈極為相似。閱讀開端從一個字母到另一個字母,在每個位點都執(zhí)行4步操作:閱讀字母;用另一個字母替代該字母;改變它的內(nèi)部形態(tài);移動到下一個位置。一張指令表就是翻譯規(guī)則或翻譯軟件,指示這些操作。“我們的設(shè)備是圖靈機的簡化版。”柯南說。

  柯南還指出,對于傳統(tǒng)計算任務(wù)而言,電子計算機速度更快、更可靠,生物計算機的主要優(yōu)勢在于其生物特性。人們能把大量信息經(jīng)過加密存儲在DNA芯片中,生物計算機處理單個步驟雖然比電子計算機要慢,但它能平行處理數(shù)萬億的化學(xué)步驟,使整體計算過程非常快。“這種技術(shù)讓我們能在一個芯片中印上數(shù)百萬像素,經(jīng)過加密后,這種芯片能存儲的圖像數(shù)量可以達到天文數(shù)字。”

  此外,這種設(shè)備能直接和生物系統(tǒng)甚至活的有機生物相互作用,因為分子計算機的4個組成部分之間都不需要接口,溶液中的分子會以一種瀑布般方式按照編好的程序進行化學(xué)反應(yīng)。

《科技日報》
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